Сразу после инсталляции в Internet Explorer включена Enhanced Security Configuration. Выражается это в постоянном блокировании захода на любой ресурс с предложением внести сайт в список доверенных, работает блокировка всплывающих окон – устанавливать/конфигурировать что-нибудь с использованием IE становится мукой.
Если Вы уверены в том, что сервер находится под защитой корпоративной системы безопасности, либо это локальный сервер, не имеющий выхода в интернет, то эту настройку безопасности можно отключить:
Start -> Administrative tools -> Server Manager
Далее смотрим раздел Security Information -> IE Enhanced Security Configuration (ESC)
Жмем Configure IE ESC и отключаем настройку для нужных групп пользователей.